avene warszawa

Jednak do 2008 r. Sekwencjonowanie genomu nowotworu wyraźnie wykazało, że wszystkie raki wyrażają mutacje somatyczne (35, 36). Obserwacje te skłoniły Allison i Vogelstein do przeprowadzenia analiz in silico danych z sekwencjonowania egzonu z raków piersi i jelita grubego, w których odkryto kilka mutacji, które według przewidywań tworzyły specyficzne dla nowotworu zmutowane antygeny komórek T CD8 + (37), ale zajęłoby to cztery lat przed uzyskaniem wsparcia eksperymentalnego w celu potwierdzenia ich przewidywań obliczeniowych. W 2012 r. Dwa niezależne raporty dostarczyły pierwszych jednoznacznych dowodów na to, że metody genomiki i bioinformatyki mogą zostać wykorzystane do identyfikacji zmutowanych białek specyficznych dla guza, które działają jako TSA. Stosując kombinację sekwencjonowania nowej generacji, przewidywania epitopu in silico i podejścia immunologicznego, Sahin i współpracownicy (38) i nasza grupa (39) niezależnie identyfikowali i walidowali odrębne TSA w mysich komórkach nowotworowych czerniaka B16-F10 i wysoce immunogennym wywołanym metylcholantrenem. (Indukowane MCA) komórki mięsaka, odpowiednio. Co ważne, badania te wykazały, że ramy czasowe potrzebne do identyfikacji TSA można skrócić do zaledwie kilku tygodni, w przeciwieństwie do miesięcy wymaganych przy użyciu konwencjonalnych metod klonowania antygenów. Co więcej, nasze badanie (39) i niezależne badanie przeprowadzone przez Dupage and Jacks (40) wykazało, że TSA były również kluczowymi celami w zakresie immunoterapii nowotworowej. proces immunologiczny, który nie tylko chroni przed rozwojem raka, ale także wyrzeźbił immunogenność nowotworów, które tworzą się u immunokompetentnego osobnika (41. 43). W następnym roku praca ta została rozszerzona na nowotwory u ludzi. Robbins i Rosenberg wykazali, że sekwencjonowanie egzonu może być stosowane do identyfikacji zmutowanych ludzkich TSA rozpoznawanych przez adoptywnie przenoszone komórki T reaktywne wobec nowotworu (44). Równolegle, Schumacher zastosował połączenie sekwencjonowania egzonu i wysokowydajnego skriningu tetrameru MHC, aby wykazać, że blokada immunologiczna z punktami kontrolnymi ułatwiła ekspansję wcześniej istniejących komórek T specyficznych dla neoantygenów nowotworowych u pacjenta z czerniakiem (45). Terapia blokująca punkt kontrolny, pierwotnie opracowana przez Allison i współpracowników, jest oparta na zdolności przeciwciał do blokowania receptorów hamujących (takich jak białko 4 związane z limfocytami T cytoksycznymi [CTLA-4]) na limfocytach T lub zubożających komórki T z receptorem hamującym, tym samym wyzwalając tłumione zależne od komórek T funkcje przeciwnowotworowe w gospodarzach nowotworowych (46. 48). Wydajność algorytmów przewidywania epitopów w celu identyfikacji ludzkich TSA została dodatkowo wykazana zarówno w analizach prospektywnych, jak i retrospektywnych przeprowadzonych przez Fritscha, Hacohen a i Wu (49, 50), Schumachera i współpracowników (51) oraz Nelsona i in. (52). Łącznie badania na myszach i ludziach sugerowały, że rzeczywiście można stosować podejścia genomiczne i bioinformatyczne w celu szybkiej identyfikacji zmutowanych białek eksprymowanych wyłącznie w komórkach nowotworowych, które działają jako neoantygeny nowotworowe. Identyfikacja mutacji swoistych dla guza i przewidywanie ich zdolności do działania jako TSA Podczas gdy te początkowe badania ujawniły siłę łączenia genomiki, bioinformatyki i podejść immunologicznych do identyfikacji zmutowanych TSA, w ciągu ostatnich kilku lat dokonano dodatkowych udoskonaleń, które dodatkowo poprawiły dokładność proces. Sekwencjonowanie nowej generacji. Postępy w technologii sekwencjonowania zmieniły naszą zdolność do dekodowania mutacji swoistych dla raka poprzez sprzężenie reakcji sekwencjonowania z detekcją inkorporacji nukleotydów dla setek milionów fragmentów genomowych w tym samym działaniu instrumentu (53). W szczególności, specyficzny dla guza lub. Somatyczny. mutacje można identyfikować za pomocą metod masowego równoległego sekwencjonowania (MPS) (17) w celu porównania DNA wyizolowanego z nowotworu w porównaniu do normalnych źródeł
[przypisy: objawy sm, oct oka, olej z nasion wiesiołka ]